DB34/T 3283-2018
副猪嗜血杆菌的分子分型MLST方法
发布时间:2018-12-29 实施时间:2019-01-29


副猪嗜血杆菌是一种常见的猪源性细菌,可引起猪链球菌病,对猪养殖业造成严重危害。为了更好地了解副猪嗜血杆菌的分布和流行情况,需要对其进行分子分型。本标准介绍了一种常用的副猪嗜血杆菌分子分型方法——MLST方法。

MLST方法是一种基于多个基因序列的分子分型方法,可以对细菌进行高分辨率的分型。该方法通过对多个基因的序列进行测序和分析,得到每个基因的不同等位基因序列,然后将这些序列组合起来,形成一个多位点序列类型(ST)。不同的ST代表不同的细菌亚型,可以用于研究细菌的种群结构、流行病学和进化等问题。

本标准规定了副猪嗜血杆菌的MLST方法,包括以下步骤:

1. 样品采集:采集副猪嗜血杆菌阳性的猪肠道、淋巴结、肺、脾等组织或分泌物样品。

2. DNA提取:使用适当的DNA提取试剂盒或方法,从样品中提取细菌DNA。

3. PCR扩增:使用特异性引物,对7个基因(adk、fumC、gyrB、mdh、purA、recA、sodA)进行PCR扩增。

4. 测序:将PCR产物进行双向测序,得到每个基因的序列。

5. 序列分析:使用相应的软件,对每个基因的序列进行比对和分析,得到每个基因的不同等位基因序列。

6. 数据分析:将7个基因的等位基因序列组合起来,形成一个多位点序列类型(ST),并将其与已知的ST进行比对,确定其亚型。

本标准还规定了实验室质量控制、数据管理和结果解释等方面的要求。

相关标准:
GB/T 4789.30-2016 食品微生物学检验 副猪嗜血杆菌检验方法
GB/T 22470.1-2008 生物技术实验室质量管理体系 第1部分:通用要求
GB/T 22470.2-2008 生物技术实验室质量管理体系 第2部分:实验室能力验证
GB/T 22470.3-2008 生物技术实验室质量管理体系 第3部分:实验室内质量控制
GB/T 22470.4-2008 生物技术实验室质量管理体系 第4部分:实验室数据管理