DB34/T 3488-2019
猪链球菌的分子分型MLST方法
发布时间:2019-12-25 实施时间:2020-01-25


猪链球菌是一种常见的病原菌,能引起多种疾病,如咽炎、皮肤感染、败血症等。为了更好地了解猪链球菌的流行病学和分子进化,需要对其进行分子分型。本标准介绍了一种常用的猪链球菌分子分型方法——多位点序列分析(MLST)方法。

MLST方法是一种基于多个核苷酸序列位点的分子分型方法,通过对多个位点的序列进行比对和分析,可以得到不同菌株之间的遗传差异。在猪链球菌的MLST方法中,选取了7个核苷酸序列位点进行分析,分别是arcC、aroE、glpF、gmk、pta、tpi和yqiL。这些位点在不同的猪链球菌菌株中具有不同的序列变异,可以用来区分不同的菌株。

使用本标准进行猪链球菌的MLST分型需要进行以下步骤:

1. 从猪链球菌培养物中提取DNA。
2. 进行PCR扩增,扩增7个核苷酸序列位点。
3. 对PCR产物进行测序,得到7个位点的序列。
4. 将序列上传至猪链球菌MLST数据库进行比对和分析。
5. 根据比对结果,确定猪链球菌的分子分型。

需要注意的是,本标准中所使用的核苷酸序列位点和分型方法仅适用于猪链球菌,不适用于其他细菌。此外,进行MLST分型需要使用专业的实验室设备和技术,需要具备一定的实验室操作和数据分析能力。

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