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玉米是我国重要的粮食作物之一,其品种繁多,为了保证种子的纯度和品质,需要进行品种纯度检测。本标准介绍了一种基于SSR分子标记的玉米品种(单交种)纯度检测方法。
1. 范围
本标准适用于玉米品种(单交种)的纯度检测。
2. 原理
利用SSR分子标记对玉米品种(单交种)进行纯度检测。首先从样品中提取DNA,然后进行PCR扩增,扩增产物经过电泳分离,最后根据扩增产物的大小和数量进行数据分析,判断样品的纯度。
3. 试剂和仪器
3.1 试剂
PCR扩增试剂盒、琼脂糖、TAE缓冲液、DNA分子量标准品等。
3.2 仪器
PCR仪、电泳仪、紫外分光光度计等。
4. 样品的提取
4.1 样品的准备
将玉米种子或幼苗样品放入离心管中,加入适量的液氮,研磨成细粉末。
4.2 DNA的提取
将细粉末加入提取液中,振荡混合,离心沉淀,取上清液,加入异丙醇,离心沉淀,取上清液,加入乙酸钠,离心沉淀,取上清液,加入等体积的冷乙醇,离心沉淀,取上清液,干燥后加入TE缓冲液,混匀,即得到DNA样品。
5. PCR扩增
5.1 PCR反应体系
PCR反应体系如下表所示:
试剂 体积/质量
10×PCR缓冲液 2.5 μL
25 mmol/L MgCl2 2.5 μL
2.5 mmol/L dNTPs 1.0 μL
10 μmol/L SSR引物 1.0 μL
Taq DNA聚合酶 0.25 μL
DNA模板 50 ng
去离子水 加至25 μL
5.2 PCR反应条件
PCR反应条件如下表所示:
步骤 温度 时间
预变性 94℃ 5 min
变性 94℃ 30 s
退火 55℃ 30 s
延伸 72℃ 30 s
最终延伸 72℃ 10 min
保温 4℃ ∞
6. 电泳分离和数据分析
将PCR扩增产物进行电泳分离,根据扩增产物的大小和数量进行数据分析,判断样品的纯度。
相关标准:
GB/T 17215.321-2008 玉米种子品质检验方法 第21部分:品种纯度检验
GB/T 17215.322-2008 玉米种子品质检验方法 第22部分:杂质检验
GB/T 17215.323-2008 玉米种子品质检验方法 第23部分:水分含量检验
GB/T 17215.324-2008 玉米种子品质检验方法 第24部分:杂质含量检验
GB/T 17215.325-2008 玉米种子品质检验方法 第25部分:萌发力检验