随着基因组学的发展,基因组信息的处理和分析变得越来越重要。基因组信息编码是基因组信息处理的关键步骤之一。ISO/IEC 23092-2:2020标准提供了一种通用的方法,用于将基因组信息编码为计算机可以处理的格式。该标准的目的是提高基因组信息的互操作性和可移植性,以便在不同的计算机系统和应用程序之间进行共享和交换。
ISO/IEC 23092-2:2020标准定义了一种基于ASN.1(抽象语法标记)的编码方法,称为GenomicASN.1。该编码方法可以用于表示各种类型的基因组信息,包括DNA序列、RNA序列、蛋白质序列和其他相关信息。GenomicASN.1编码方法具有以下特点:
1. 可扩展性:可以轻松地添加新的基因组信息类型和属性。
2. 可读性:GenomicASN.1编码方法使用可读的标记和注释,使其易于理解和解释。
3. 可移植性:GenomicASN.1编码方法可以在不同的计算机系统和应用程序之间进行共享和交换。
4. 灵活性:GenomicASN.1编码方法可以根据需要进行自定义,以满足特定的应用程序需求。
ISO/IEC 23092-2:2020标准还定义了一些基于GenomicASN.1编码方法的数据类型和编码规则。这些数据类型和编码规则可以用于表示基因组信息的各个方面,包括序列、注释、变异、表达和功能等。此外,该标准还提供了一些示例,以帮助用户了解如何使用GenomicASN.1编码方法来表示基因组信息。
相关标准
- ISO/IEC 23092-1:2020《信息技术——基因组信息表示——第1部分:概述和基本概念》
- ISO/IEC 23092-3:2020《信息技术——基因组信息表示——第3部分:基于XML的编码方法》
- ISO/IEC 23092-4:2020《信息技术——基因组信息表示——第4部分:基于JSON的编码方法》
- ISO/IEC 23092-5:2020《信息技术——基因组信息表示——第5部分:基于二进制的编码方法》
- ISO/IEC 23093:2020《信息技术——基因组信息表示——基因组信息查询语言》