ISO 21393:2021
Genomics informatics — Omics Markup Language (OML)
发布时间:2021-07-30 实施时间:


OML是一种基于XML(可扩展标记语言)的标记语言,它提供了一种通用的、可扩展的、可重复使用的数据格式,以描述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等“组学”数据。OML的设计目标是提供一种通用的、可扩展的、可重复使用的数据格式,以促进组学数据的共享和交流。OML的设计目标是提供一种通用的、可扩展的、可重复使用的数据格式,以促进组学数据的共享和交流。

OML的主要特点包括:

1. 可扩展性:OML可以通过添加新的标记来扩展其功能,以适应不断变化的组学数据需求。

2. 可重复使用性:OML的标记可以在不同的组学数据集之间重复使用,从而提高数据的可重复性和可比性。

3. 可互操作性:OML可以与其他标准格式(如FASTA、GFF、BED等)进行互操作,从而促进组学数据的共享和交流。

4. 可读性:OML的标记具有良好的可读性,使得人类用户可以轻松地理解和编辑OML文件。

5. 可验证性:OML的标记可以通过XML Schema进行验证,从而确保数据的正确性和一致性。

OML的应用范围包括但不限于:

1. 基因组学数据:包括基因序列、基因注释、基因表达等。

2. 转录组学数据:包括RNA序列、RNA表达、剪接变异等。

3. 蛋白质组学数据:包括蛋白质序列、蛋白质结构、蛋白质表达等。

4. 代谢组学数据:包括代谢物注释、代谢通路、代谢物浓度等。

OML的应用可以促进组学数据的共享和交流,从而加速组学研究的进展。OML还可以作为其他组学标准的基础,如Genome Variation Format(GVF)、Proteomics Standards Initiative(PSI)等。

相关标准
ISO 19115:2019 地理信息-元数据
ISO 19110:2005 地理信息-特征编码
ISO 19111:2019 地理信息-空间参考系统
ISO 19123:2011 地理信息-网格
ISO 19136:2007 地理信息-Geography Markup Language (GML)