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玉米是我国重要的粮食作物之一，品种繁多，品质差异较大。为了保证玉米品种的纯度和质量，需要进行品种鉴定。SSR分子标记法是一种常用的分子生物学技术，可以通过PCR扩增和电泳分离等步骤，对玉米品种进行鉴定和亲缘关系分析。

1. 适用范围
本标准适用于玉米品种鉴定和亲缘关系分析。

2. 术语和定义
2.1 SSR分子标记：简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR）是一种广泛存在于生物基因组中的DNA序列，由重复单元组成，长度通常在1-6个碱基对之间。
2.2 PCR扩增：聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）是一种体外扩增DNA的技术，可以在短时间内扩增出大量的DNA片段。
2.3 电泳分离：电泳是一种利用电场作用下，带电粒子在介质中运动的现象，可以将DNA片段按照大小分离出来。

3. 样品的采集和DNA的提取
3.1 样品的采集
样品采集应选择玉米叶片或种子等组织，避免使用受污染的样品。
3.2 DNA的提取
DNA的提取应根据样品的不同，选择合适的提取方法。常用的DNA提取方法包括CTAB法、酚/氯仿法等。

4. PCR扩增
4.1 引物的设计
根据玉米基因组序列，设计适合的引物，通常选择2-4对引物进行扩增。
4.2 PCR反应体系
PCR反应体系应根据实验需要进行调整，常用的反应体系包括PCR Buffer、dNTPs、MgCl2、Taq聚合酶、模板DNA和引物等。
4.3 PCR反应条件
PCR反应条件应根据引物的特性进行调整，常用的PCR反应条件包括温度、时间和循环次数等。

5. 电泳分离和数据分析
5.1 电泳分离
PCR扩增后的产物可以通过琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳等方法进行分离。
5.2 数据分析
根据电泳图谱，可以计算出不同样品之间的遗传距离和相似系数等指标，进行品种鉴定和亲缘关系分析。

相关标准：
GB/T 17215.321-2008 玉米种子品质检验方法 玉米种子品种纯度检验方法
GB/T 17215.322-2008 玉米种子品质检验方法 玉米种子品种纯度检验方法
GB/T 17215.323-2008 玉米种子品质检验方法 玉米种子品种纯度检验方法
GB/T 17215.324-2008 玉米种子品质检验方法 玉米种子品种纯度检验方法
GB/T 17215.325-2008 玉米种子品质检验方法 玉米种子品种纯度检验方法