水稻是我国的主要粮食作物之一，其品种纯度鉴定对于保障粮食生产和品质安全具有重要意义。传统的品种鉴定方法主要依靠形态学特征和生物学特性，但这种方法存在着误判率高、耗时长、受环境影响大等缺点。随着分子生物学和生物技术的发展，DNA分子标记技术成为了水稻品种纯度鉴定的重要手段之一。

SSR（Simple Sequence Repeat）是一种广泛存在于生物基因组中的DNA序列重复单元，其长度通常在1-6个碱基对之间。SSR分子标记法是利用PCR技术扩增SSR位点，通过电泳分离和数据分析，确定不同品种之间的遗传差异，从而实现品种纯度鉴定和遗传多样性分析。

本标准规定了水稻品种纯度鉴定的SSR分子标记法，具体步骤如下：

1. 样品采集：选择健康、生长良好的水稻植株，采集新鲜叶片或幼穗，避免受到污染和损伤。

2. DNA提取：采用适当的DNA提取试剂盒或自制试剂，从样品中提取高质量的基因组DNA。

3. PCR扩增：根据所选用的SSR引物，进行PCR扩增反应。PCR反应体系和条件应根据引物的特性进行优化，以获得高效、特异的扩增产物。

4. 电泳分离：将PCR扩增产物进行电泳分离，根据不同长度的扩增产物进行分析和判读。

5. 数据分析：根据电泳图谱，进行数据分析和处理，确定不同品种之间的遗传差异和相似性。

本标准的实施可以提高水稻品种纯度鉴定的准确性和可靠性，同时也可以为水稻遗传多样性研究提供重要的技术支持。

相关标准
GB/T 17215.321-2008 水稻种子品质检验方法 稻谷品种纯度检验方法

NY/T 3749-2020 水稻品种纯度鉴定 SNP分子标记法

NY/T 3750-2020 水稻品种纯度鉴定 EST-SSR分子标记法

NY/T 3751-2020 水稻品种纯度鉴定 ISSR分子标记法

NY/T 3752-2020 水稻品种纯度鉴定 RAPD分子标记法