NY/T 3754-2020
甘蔗品种真实性鉴定 SSR分子标记法
发布时间:2020-11-12 实施时间:2021-04-01


甘蔗是一种重要的经济作物,其品种的真实性鉴定对于保护品种权益、促进品种改良和推广具有重要意义。SSR分子标记法是一种常用的分子生物学技术,具有高度的多态性和稳定性,被广泛应用于植物品种鉴定、遗传多样性分析等领域。本标准旨在规范甘蔗品种真实性鉴定的SSR分子标记方法,以提高鉴定结果的准确性和可靠性。

1.范围
本标准适用于甘蔗品种真实性鉴定的SSR分子标记法。

2.引用标准
GB/T 191-2008 线性尺寸测量用量规
GB/T 8170-2008 数字化处理的数据尺度和分辨率
GB/T 12346-2006 生物技术术语
GB/T 14233.1-2008 环境条件与测试程序的基本规定 第1部分:环境条件(IEC 60068-1:2007,MOD)
GB/T 14233.2-2005 环境条件与试验程序的基本规定 第2部分:试验程序(IEC 60068-2:2005,MOD)

3.术语和定义
3.1 甘蔗品种真实性鉴定
指通过分子生物学技术等手段,对甘蔗品种进行鉴定,以确定其品种的真实性。
3.2 SSR分子标记
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)是一种广泛存在于生物基因组中的DNA序列,其长度通常在1-6个碱基对之间,具有高度的多态性和稳定性。SSR分子标记是利用PCR扩增SSR位点,通过电泳分析等方法对不同品种的DNA样品进行比较,以确定其品种的真实性。

4.样品采集
4.1 样品选择
选择健康、生长良好、无病虫害的甘蔗植株,采集新鲜叶片或嫩茎,避免采集老化、病变或死亡的组织。
4.2 样品处理
将采集的样品放入冰箱或液氮中保存,避免样品腐烂或变质。

5.DNA提取
5.1 样品研磨
将样品取出,用液氮研磨成粉末状,加入提取液中,混匀后放置于65℃水浴中静置10min。
5.2 DNA提取
将样品提取液离心,取上清液,加入等体积的氯仿-异丙醇(24:1)混匀,离心后取上清液,加入等体积的冷乙醇,混匀后放置于-20℃冷冻箱中沉淀DNA,离心后弃上清液,用70%乙醇洗涤DNA沉淀,离心后弃上清液,将DNA沉淀用TE缓冲液重悬。

6.PCR扩增
6.1 引物设计
根据已知的甘蔗SSR位点序列,设计适合的引物对,以保证扩增产物的特异性和稳定性。
6.2 PCR反应体系
PCR反应体系如下表所示:

6.3 PCR反应程序
PCR反应程序如下表所示:

7.电泳分析
7.1 样品制备
将PCR扩增产物与等体积的载体溶液混匀,加入适量的荧光素标记,混匀后加入等体积的甲醇,混匀后离心,取上清液,加入等体积的载体溶液,混匀后离心,取上清液,加入等体积的甲醇,混匀后离心,取上清液,将样品用电泳样品缓冲液重悬。
7.2 电泳条件
电泳条件如下表所示:

8.结果分析
根据电泳图谱,对PCR扩增产物进行分析,以确定甘蔗品种的真实性。

相关标准
GB/T 12346-2006 生物技术术语
GB/T 14233.1-2008 环境条件与测试程序的基本规定 第1部分:环境条件(IEC 60068-1:2007,MOD)
GB/T 14233.2-2005 环境条件与试验程序的基本规定 第2部分:试验程序(IEC 60068-2:2005,MOD)
GB/T 191-2008 线性尺寸测量用量规
GB/T 8170-2008 数字化处理的数据尺度和分辨率