SN/T 3483-2013
松江鲈鱼的物种鉴定方法 PCR方法
发布时间:2013-03-01 实施时间:2013-09-16


松江鲈鱼是一种重要的淡水鱼类,具有经济和生态价值。为了保护和管理松江鲈鱼资源,需要对其进行准确的物种鉴定。本标准提供了一种基于PCR方法的松江鲈鱼物种鉴定方法。

1. 原理
本方法利用PCR扩增松江鲈鱼线粒体DNA的COI基因片段,通过测序和比对,确定松江鲈鱼的物种。

2. 试剂和仪器
2.1 试剂
PCR扩增试剂盒、DNA提取试剂盒、琼脂糖、DNA分子量标准品、PCR产物纯化试剂盒等。
2.2 仪器
PCR扩增仪、电泳仪、DNA测序仪等。

3. 样品采集和DNA提取
3.1 样品采集
采集松江鲈鱼的肌肉组织或鳃组织,避免污染和交叉污染。
3.2 DNA提取
按照DNA提取试剂盒说明书进行提取。

4. PCR扩增
4.1 引物设计
设计一对特异性引物,扩增松江鲈鱼线粒体COI基因片段。
4.2 PCR反应体系
PCR反应体系如下表所示:

试剂 体积/质量 最终浓度

10×PCR缓冲液 2.5 μL 1×
2.5 mM dNTPs混合液 2 μL 0.2 mM
10 μM引物1 0.5 μL 0.2 μM
10 μM引物2 0.5 μL 0.2 μM
2.5 U/μL Taq DNA聚合酶 0.2 μL 1 U
模板DNA 1 μL 50 ng/μL
去离子水 18.3 μL -

4.3 PCR程序
PCR程序如下表所示:

步骤 温度 时间

初始变性 94℃ 5 min
循环变性 94℃ 30 s
退火 55℃ 30 s
延伸 72℃ 45 s
终止延伸 72℃ 10 min
保温 4℃ ∞

4.4 PCR产物检测
将PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,观察PCR产物的大小和清晰度。

5. PCR产物纯化和测序
5.1 PCR产物纯化
将PCR产物进行纯化,去除杂质和引物。
5.2 测序
将PCR产物进行测序,比对松江鲈鱼COI基因序列,确定松江鲈鱼的物种。

相关标准:
GB/T 19484-2003 鱼类DNA条形码序列的获取和分析方法
GB/T 19485-2004 鱼类DNA条形码数据库建设规范
GB/T 19486-2004 鱼类DNA条形码序列的质量控制标准
GB/T 19487-2004 鱼类DNA条形码序列的命名规则
GB/T 19488-2004 鱼类DNA条形码序列的存储和共享规范