柳树是我国重要的经济林木之一,具有重要的经济和生态价值。随着柳树栽培品种的不断增多,品种鉴别和鉴定变得越来越重要。传统的鉴别方法主要依靠形态学特征和生理生化指标,但这些方法存在着主观性、受环境影响大等缺点。因此,利用分子标记技术进行柳树品种鉴别和鉴定具有重要的意义。
本标准主要介绍了柳树品种微卫星标记鉴别技术的实验室操作流程、数据分析方法和结果判定标准。具体内容如下:
1. 实验室操作流程
1.1 样品采集和DNA提取
样品采集应选择健康、生长良好的柳树叶片,避免受到病虫害和环境污染。DNA提取应采用标准的CTAB法或商用DNA提取试剂盒。
1.2 微卫星PCR扩增
根据实验需要选择合适的微卫星引物,进行PCR扩增。PCR反应体系和条件应根据引物的特性进行优化。
1.3 PCR产物检测和分析
PCR产物应通过琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳进行检测和分析。分析结果应记录PCR产物的大小和数量。
2. 数据分析方法
2.1 数据录入和处理
将PCR产物的大小和数量数据录入电脑,进行数据处理和分析。数据处理应包括数据清洗、数据标准化和数据归一化等步骤。
2.2 相似系数计算和聚类分析
根据PCR产物的大小和数量数据,计算样品之间的相似系数,并进行聚类分析。聚类分析应采用UPGMA法或NJ法。
3. 结果判定标准
3.1 相似系数判定
根据聚类分析结果,计算样品之间的相似系数。相似系数大于0.8的样品可以判定为同一品种,相似系数小于0.8的样品应进一步进行鉴别。
3.2 鉴别结果判定
根据PCR产物的大小和数量数据,结合聚类分析结果,判定样品的品种。如果样品与已知品种的PCR产物大小和数量数据完全一致,则可以判定为该品种;如果样品与已知品种的PCR产物大小和数量数据不完全一致,则应进一步进行鉴别。
相关标准
GB/T 19277-2015 植物遗传资源DNA分子标记技术通用方法
GB/T 19423-2004 植物品种鉴定技术规范
GB/T 19424-2004 植物品种命名规则
GB/T 19425-2004 植物品种命名登记规则
GB/T 19426-2004 植物品种命名审定规则