GB/T 12728-2006 食用菌术语共分为三个部分，分别是术语和定义、分类和命名以及其他。其中，术语和定义部分包括了食用菌的基本术语和定义，如菌丝、子实体、菌种等；分类和命名部分则介绍了食用菌的分类方法和命名规则，如按形态分类、按生态分类、按营养分类等；其他部分则包括了一些与食用菌相关的术语和定义，如菌根、菌核、菌柄等。

在GB/T 12728-2006 食用菌术语中，对于一些常见的食用菌，也给出了它们的分类和命名规则。例如，对于香菇，其分类为担子菌门、蘑菇纲、蘑菇目、蘑菇科、香菇属，命名为Agaricus bisporus；对于金针菇，其分类为担子菌门、担子菌纲、鹅膏菌目、金针菇科、金针菇属，命名为Flammulina velutipes。

此外，GB/T 12728-2006 食用菌术语还规定了一些术语的使用范围和定义，如“食用菌”指人类食用的真菌，不包括毒菌和有毒菌；“野生食用菌”指在自然界中生长的、人类食用的真菌，不包括栽培食用菌等。

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