GB/T 40419-2021
健康信息学 基因组序列变异置标语言(GSVML)
发布时间:2021-10-11 实施时间:2022-05-01
随着高通量测序技术的发展,基因组数据的产生和应用越来越广泛。基因组序列变异是基因组数据中最重要的信息之一,对于研究人类疾病的发生机制、诊断和治疗具有重要意义。然而,由于不同实验室和研究者使用的测序平台、分析软件和变异置标方法不同,导致基因组数据的可比性和可重复性较差,限制了基因组数据的共享和应用。为了解决这一问题,GSVML标准应运而生。
GSVML标准定义了一种基因组序列变异置标语言,用于描述基因组序列的变异信息。GSVML标准包括三个部分:元数据、变异描述和变异注释。元数据包括样本信息、测序信息和变异置标信息等;变异描述包括单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失(INDEL)、结构变异等;变异注释包括变异的功能、频率、致病性等。GSVML标准化了基因组序列变异置标的格式和内容,有助于提高基因组数据的可比性和可重复性,促进基因组数据的共享和应用。
GSVML标准的应用可以带来多方面的好处。首先,GSVML标准化了基因组序列变异置标的格式和内容,使得不同实验室和研究者之间的基因组数据可以进行比较和共享。其次,GSVML标准可以提高基因组数据的可重复性,减少数据分析的误差和不确定性。最后,GSVML标准可以促进基因组数据的应用,加速人类疾病的研究和治疗。
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