GB/T 38481-2020
微生物超低频突变测定 双重测序法
发布时间:2020-11-19 实施时间:2020-11-19


微生物是指在自然界中广泛存在的一类生物,包括细菌、真菌、病毒等。微生物的突变频率是其进化和适应环境的重要指标之一。超低频突变是指在微生物群体中,某个基因发生的突变频率非常低,通常在10^-6到10^-9之间。超低频突变的测定对于研究微生物的进化、适应性和抗药性等方面具有重要意义。

本标准采用双重测序法进行微生物超低频突变的测定。双重测序法是指对同一DNA样品进行两次独立的测序,通过比对两次测序结果,可以减少测序误差,提高测序准确性。具体步骤如下:

1. 样品处理:将微生物样品进行培养、收获和处理,获得纯化的微生物DNA。

2. DNA提取:采用适当的方法提取微生物DNA,如酚/氯仿法、商用DNA提取试剂盒等。

3. PCR扩增:设计适当的引物,对目标基因进行PCR扩增。PCR扩增条件应根据实验需要进行优化,包括反应体系、温度、时间等。

4. 双重测序:对PCR产物进行双重测序,可以采用Illumina、PacBio等商用测序平台。在测序过程中,应注意质量控制,包括样品质量、测序质量、数据质量等。

5. 数据分析:对测序数据进行比对、过滤、统计和分析,计算出目标基因的突变频率。

本标准的实施可以提高微生物超低频突变的测定准确性和可重复性,为微生物进化和适应性研究提供重要的技术支持。

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