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BS ISO/IEC 23092-2. Information technology. Genomic information representation - Part 2. Coding of genomic information
发布时间:2022-02-11 实施时间:


BS ISO/IEC 23092-2标准的制定旨在解决基因组信息在不同计算机系统和应用程序之间交换和共享的问题。该标准提供了一种通用的方法来表示和编码基因组信息,以确保数据的一致性和互操作性。

该标准的主要内容包括基因组信息的编码方法、编码格式、数据类型、数据结构和数据元素等。其中,编码方法包括直接编码和间接编码两种方式。直接编码是将基因组信息直接编码成二进制数据,而间接编码则是将基因组信息转换为其他数据类型,如文本或XML格式,然后再进行编码。

在编码格式方面,该标准规定了两种主要的编码格式:二进制编码和文本编码。二进制编码是将基因组信息编码为二进制数据,而文本编码则是将基因组信息编码为可读的文本格式。此外,该标准还规定了一种基于XML的编码格式,用于在基因组信息和其他相关信息之间进行交换。

在数据类型方面,该标准定义了一些基本的数据类型,如整数、浮点数、布尔值和字符串等。此外,该标准还定义了一些复杂的数据类型,如序列、注释、变异和表达等。这些数据类型可以用于表示基因组信息的不同方面,如基因序列、蛋白质序列、基因功能注释、变异类型和基因表达水平等。

在数据结构方面,该标准定义了一些基本的数据结构,如数组、列表和字典等。这些数据结构可以用于组织和管理基因组信息的不同方面,如基因组序列、注释、变异和表达等。此外,该标准还定义了一些复杂的数据结构,如基因组组装和比对等。

在数据元素方面,该标准定义了一些基本的数据元素,如基因、转录本、外显子和内含子等。这些数据元素可以用于表示基因组信息的不同方面,如基因组序列、注释、变异和表达等。此外,该标准还定义了一些复杂的数据元素,如基因组区域和基因组特征等。

总之,BS ISO/IEC 23092-2标准为基因组信息的编码提供了一种通用的方法,以确保数据的一致性和互操作性。该标准的制定将有助于促进基因组信息的交换和共享,推动基因组学研究的发展。

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